Apikotomija se ukvarja z manjšimi kirurškimi storitvami, to je odstranjevanjem vrha korenine zoba.
Praviloma je poseg potrebno opraviti v primeru, ko med zdravljenjem zoba, ponovnim čiščenjem in polnjenjem korenovih kanalov ni bil dosežen cilj zmanjšanja vnetja okrog vrha korenine zoba.